<html>
<head>
<style>
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 10pt;
font-family:Verdana
}
</style>
</head>
<body class='hmmessage'>
Hi Tim,<br><br>Perhaps you should try the adaptive local convex hull
method proposed by Wayne Getz (Getz WM, Fortmann-Roe S, Cross PC, et al. (2007) LoCoH: nonparametric kernel methods for constructing home ranges and utilization distributions. PLoS ONE 2: e207. doi: 10.1371/journal.pone.0000207). It seems to
represent home range use much better than kernels, and you don't have
the awkward business of chosing the right bandwidth (Huck M, Davison J and Roper TJ (2008) Comparison of two sampling protocols and four home range estimators using radio-tracking data from urban badgers. Wildl Biol 14: 467-477). The only problem:
If you have many data points it might take lots of time. In adehabitat
LoCoHs are called NNCH.<br><br>Good luck,<br>Maren<br><br>------------------------<br>Maren Huck <br><pre class="EC_EC_EC_EC_EC_EC_moz-signature"><font style="" face="Arial">Mammal Research Institute</font><font style="" face="Arial"><br></font><font style="" face="Arial">Polish Academy of Sciences</font><font style="" face="Arial"><br></font><font style="" face="Arial">Waszkiewicza 1</font><font style="" face="Arial"><br></font><font style="" face="Arial">17-230 Bia³owie¿a</font><font style="" face="Arial"><br></font><font style="" face="Arial">Poland</font><font style="" face="Arial"><br></font><font style="" face="Arial">tel: +48-85-682 7781</font></pre>
some nepotistic links:<br><style>
.ExternalClass p.EC_MsoNormal, .ExternalClass li.EC_MsoNormal, .ExternalClass div.EC_MsoNormal
{margin-bottom:.0001pt;font-size:12.0pt;font-family:'Times New Roman';}
@page Section1
{size:595.3pt 841.9pt;}
.ExternalClass div.EC_Section1
{page:Section1;}
</style>

<p class="EC_EC_EC_EC_MsoNormal"><span style="" lang="EN-GB">http://www.Myspace.com/steensolobass</span></p><p class="EC_EC_EC_EC_MsoNormal"><span style="" lang="EN-GB">http://www.nellyboyd.org/</span></p><p class="EC_EC_EC_EC_MsoNormal"><span style="" lang="EN-GB">http://estudioviabrasil.wordpress.com/</span><span style="" lang="EN-GB"></span></p>

<br><br><br><br><br>&gt; Date: Sun, 12 Jul 2009 12:37:23 -0700<br>&gt; From: mudiver1200@yahoo.com<br>&gt; To: animov@faunalia.it<br>&gt; Subject: [AniMov] Clipping area from home range estimates<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; Dear List,<br>&gt; <br>&gt; I am trying to use Adehabitat to analyze the home range and movement patterns of fish (manta rays, sharks, and various species of reef fish) in Hawaii, but have not found a way to clip land area out of the animals home range.  Most of the fish I study stay fairly close to shore, moving along a sinuous coastline.  I have used adehabitat to estimate their home range (I am mostly interested in kernel HR's), but need to either limit the calculations to only include water areas during the calculation or clip out the land area after the kernel has been calculated.  Is there a way to use a shapefile or other projected map file to either limit the kernel or to clip out the area post-processing?  I am fairly new to R and adehabitat, and am working in Windows.<br>&gt; <br>&gt; Thanks for your help,<br>&gt; <br>&gt; Tim<br>&gt; <br>&gt; Tim Clark<br>&gt; Department of Zoology <br>&gt; University of Hawaii<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt;       <br>&gt; _______________________________________________<br>&gt; AniMov mailing list<br>&gt; AniMov@faunalia.it<br>&gt; http://lists.faunalia.it/cgi-bin/mailman/listinfo/animov<br><br /><hr />Posteingang immer voll? Der erste Speicher, der mitwächst: <a href='http://redirect.gimas.net/?n=M0906WLHM1' target='_new'>Unbegrenzter Speicher bei Windows Live Hotmail!</a></body>
</html>